Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITSN1Q15811 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITSN1Q15811 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms