Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TAF1CQ15572 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1CQ15572 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1CQ15572 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1CQ15572 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1CQ15572 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1CQ15572 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1CQ15572 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1CQ15572 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1CQ15572 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1CQ15572 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1CQ15572 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1CQ15572 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1CQ15572 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1CQ15572 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1CQ15572 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1CQ15572 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1CQ15572 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
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