Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
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