Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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BRD3Q15059 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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BRD3Q15059 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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BRD3Q15059 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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BRD3Q15059 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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BRD3Q15059 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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BRD3Q15059 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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BRD3Q15059 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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