Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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LAPTM4AQ15012 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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