Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GINS1Q14691 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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