Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMC1AQ14683 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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