Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SEMA3AQ14563 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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