Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EBI3Q14213 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms