Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms