Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FAM53BQ14153 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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FAM53BQ14153 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53BQ14153 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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