Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CDK13Q14004 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms