Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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KCNC3Q14003 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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