Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSTA3Q13630 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSTA3Q13630 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSTA3Q13630 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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TSTA3Q13630 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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TSTA3Q13630 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSTA3Q13630 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSTA3Q13630 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TSTA3Q13630 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSTA3Q13630 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSTA3Q13630 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSTA3Q13630 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSTA3Q13630 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSTA3Q13630 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSTA3Q13630 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSTA3Q13630 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSTA3Q13630 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSTA3Q13630 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSTA3Q13630 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSTA3Q13630 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSTA3Q13630 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSTA3Q13630 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSTA3Q13630 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSTA3Q13630 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSTA3Q13630 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSTA3Q13630 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSTA3Q13630 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSTA3Q13630 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSTA3Q13630 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TSTA3Q13630 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms