Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
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CUL4AQ13619 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
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