Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BFSP2Q13515 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BFSP2Q13515 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BFSP2Q13515 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BFSP2Q13515 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BFSP2Q13515 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BFSP2Q13515 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BFSP2Q13515 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BFSP2Q13515 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BFSP2Q13515 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BFSP2Q13515 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BFSP2Q13515 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BFSP2Q13515 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
BFSP2Q13515 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BFSP2Q13515 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BFSP2Q13515 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BFSP2Q13515 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BFSP2Q13515 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BFSP2Q13515 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BFSP2Q13515 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BFSP2Q13515 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BFSP2Q13515 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BFSP2Q13515 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BFSP2Q13515 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BFSP2Q13515 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BFSP2Q13515 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BFSP2Q13515 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BFSP2Q13515 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BFSP2Q13515 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BFSP2Q13515 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BFSP2Q13515 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BFSP2Q13515 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
BFSP2Q13515 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BFSP2Q13515 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BFSP2Q13515 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BFSP2Q13515 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BFSP2Q13515 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
BFSP2Q13515 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BFSP2Q13515 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BFSP2Q13515 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BFSP2Q13515 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BFSP2Q13515 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BFSP2Q13515 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BFSP2Q13515 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BFSP2Q13515 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BFSP2Q13515 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BFSP2Q13515 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BFSP2Q13515 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BFSP2Q13515 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BFSP2Q13515 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BFSP2Q13515 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BFSP2Q13515 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BFSP2Q13515 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BFSP2Q13515 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BFSP2Q13515 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BFSP2Q13515 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BFSP2Q13515 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BFSP2Q13515 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BFSP2Q13515 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BFSP2Q13515 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BFSP2Q13515 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BFSP2Q13515 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BFSP2Q13515 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BFSP2Q13515 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BFSP2Q13515 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BFSP2Q13515 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BFSP2Q13515 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BFSP2Q13515 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BFSP2Q13515 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BFSP2Q13515 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BFSP2Q13515 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BFSP2Q13515 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BFSP2Q13515 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BFSP2Q13515 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BFSP2Q13515 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BFSP2Q13515 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BFSP2Q13515 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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