Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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