Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATMQ13315 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATMQ13315 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATMQ13315 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATMQ13315 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATMQ13315 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATMQ13315 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATMQ13315 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATMQ13315 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATMQ13315 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATMQ13315 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATMQ13315 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATMQ13315 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATMQ13315 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATMQ13315 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATMQ13315 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATMQ13315 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATMQ13315 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATMQ13315 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATMQ13315 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATMQ13315 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATMQ13315 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATMQ13315 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATMQ13315 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATMQ13315 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATMQ13315 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATMQ13315 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATMQ13315 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATMQ13315 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATMQ13315 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATMQ13315 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATMQ13315 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATMQ13315 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATMQ13315 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATMQ13315 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATMQ13315 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATMQ13315 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATMQ13315 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATMQ13315 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATMQ13315 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATMQ13315 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATMQ13315 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATMQ13315 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATMQ13315 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATMQ13315 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATMQ13315 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATMQ13315 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATMQ13315 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATMQ13315 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATMQ13315 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATMQ13315 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATMQ13315 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATMQ13315 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATMQ13315 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATMQ13315 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATMQ13315 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATMQ13315 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATMQ13315 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATMQ13315 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATMQ13315 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATMQ13315 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATMQ13315 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATMQ13315 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATMQ13315 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATMQ13315 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATMQ13315 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATMQ13315 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATMQ13315 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATMQ13315 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATMQ13315 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATMQ13315 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATMQ13315 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATMQ13315 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATMQ13315 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATMQ13315 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATMQ13315 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATMQ13315 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATMQ13315 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATMQ13315 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATMQ13315 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATMQ13315 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATMQ13315 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATMQ13315 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATMQ13315 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATMQ13315 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATMQ13315 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATMQ13315 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATMQ13315 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATMQ13315 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATMQ13315 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATMQ13315 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATMQ13315 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATMQ13315 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATMQ13315 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATMQ13315 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATMQ13315 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATMQ13315 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATMQ13315 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATMQ13315 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATMQ13315 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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