Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
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