Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME3Q13232 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME3Q13232 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME3Q13232 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME3Q13232 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME3Q13232 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NME3Q13232 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME3Q13232 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME3Q13232 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME3Q13232 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME3Q13232 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME3Q13232 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME3Q13232 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME3Q13232 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME3Q13232 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME3Q13232 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME3Q13232 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME3Q13232 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME3Q13232 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME3Q13232 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME3Q13232 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME3Q13232 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME3Q13232 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME3Q13232 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME3Q13232 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME3Q13232 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME3Q13232 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME3Q13232 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME3Q13232 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME3Q13232 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME3Q13232 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME3Q13232 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME3Q13232 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME3Q13232 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME3Q13232 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME3Q13232 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME3Q13232 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME3Q13232 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME3Q13232 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME3Q13232 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME3Q13232 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME3Q13232 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME3Q13232 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NME3Q13232 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NME3Q13232 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NME3Q13232 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NME3Q13232 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
NME3Q13232 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NME3Q13232 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NME3Q13232 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NME3Q13232 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NME3Q13232 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NME3Q13232 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NME3Q13232 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NME3Q13232 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NME3Q13232 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NME3Q13232 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME3Q13232 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME3Q13232 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME3Q13232 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME3Q13232 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME3Q13232 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME3Q13232 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME3Q13232 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME3Q13232 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NME3Q13232 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME3Q13232 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME3Q13232 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME3Q13232 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME3Q13232 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME3Q13232 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME3Q13232 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME3Q13232 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME3Q13232 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME3Q13232 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME3Q13232 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME3Q13232 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME3Q13232 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME3Q13232 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME3Q13232 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME3Q13232 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME3Q13232 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME3Q13232 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME3Q13232 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME3Q13232 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME3Q13232 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME3Q13232 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME3Q13232 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME3Q13232 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME3Q13232 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME3Q13232 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME3Q13232 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME3Q13232 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME3Q13232 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME3Q13232 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME3Q13232 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME3Q13232 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME3Q13232 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME3Q13232 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME3Q13232 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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