Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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GPS1Q13098 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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GPS1Q13098 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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GPS1Q13098 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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GPS1Q13098 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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GPS1Q13098 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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