Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
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