Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
GRIN2AQ12879 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GRIN2AQ12879 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
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