Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EP300Q09472 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EP300Q09472 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EP300Q09472 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EP300Q09472 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EP300Q09472 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EP300Q09472 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EP300Q09472 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EP300Q09472 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EP300Q09472 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EP300Q09472 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EP300Q09472 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EP300Q09472 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EP300Q09472 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EP300Q09472 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EP300Q09472 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EP300Q09472 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EP300Q09472 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EP300Q09472 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EP300Q09472 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EP300Q09472 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EP300Q09472 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EP300Q09472 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EP300Q09472 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EP300Q09472 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EP300Q09472 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EP300Q09472 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EP300Q09472 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EP300Q09472 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EP300Q09472 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EP300Q09472 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EP300Q09472 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EP300Q09472 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EP300Q09472 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EP300Q09472 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EP300Q09472 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EP300Q09472 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EP300Q09472 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EP300Q09472 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EP300Q09472 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EP300Q09472 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EP300Q09472 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EP300Q09472 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EP300Q09472 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EP300Q09472 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EP300Q09472 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EP300Q09472 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EP300Q09472 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EP300Q09472 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EP300Q09472 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EP300Q09472 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EP300Q09472 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EP300Q09472 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EP300Q09472 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EP300Q09472 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EP300Q09472 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EP300Q09472 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EP300Q09472 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EP300Q09472 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EP300Q09472 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EP300Q09472 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EP300Q09472 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EP300Q09472 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EP300Q09472 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EP300Q09472 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EP300Q09472 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EP300Q09472 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EP300Q09472 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EP300Q09472 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EP300Q09472 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EP300Q09472 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EP300Q09472 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EP300Q09472 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EP300Q09472 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EP300Q09472 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EP300Q09472 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EP300Q09472 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EP300Q09472 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EP300Q09472 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EP300Q09472 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EP300Q09472 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EP300Q09472 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EP300Q09472 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EP300Q09472 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EP300Q09472 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EP300Q09472 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EP300Q09472 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EP300Q09472 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EP300Q09472 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EP300Q09472 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EP300Q09472 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EP300Q09472 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EP300Q09472 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EP300Q09472 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EP300Q09472 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EP300Q09472 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EP300Q09472 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EP300Q09472 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EP300Q09472 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EP300Q09472 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms