Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP4Q09028 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP4Q09028 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms