Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
DHX9Q08211 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHX9Q08211 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms