Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBQ06643 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBQ06643 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBQ06643 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBQ06643 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBQ06643 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBQ06643 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBQ06643 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBQ06643 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBQ06643 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBQ06643 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBQ06643 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBQ06643 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBQ06643 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBQ06643 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBQ06643 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBQ06643 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBQ06643 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBQ06643 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBQ06643 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBQ06643 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBQ06643 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBQ06643 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBQ06643 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBQ06643 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBQ06643 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBQ06643 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBQ06643 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBQ06643 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBQ06643 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBQ06643 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBQ06643 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBQ06643 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBQ06643 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBQ06643 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBQ06643 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBQ06643 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBQ06643 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBQ06643 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBQ06643 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBQ06643 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBQ06643 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBQ06643 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBQ06643 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBQ06643 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBQ06643 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBQ06643 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBQ06643 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBQ06643 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBQ06643 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBQ06643 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBQ06643 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBQ06643 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBQ06643 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBQ06643 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBQ06643 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBQ06643 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBQ06643 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBQ06643 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBQ06643 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBQ06643 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LTBQ06643 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LTBQ06643 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBQ06643 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBQ06643 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBQ06643 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBQ06643 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBQ06643 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBQ06643 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBQ06643 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBQ06643 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBQ06643 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBQ06643 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBQ06643 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBQ06643 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBQ06643 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBQ06643 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBQ06643 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBQ06643 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBQ06643 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBQ06643 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBQ06643 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBQ06643 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBQ06643 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBQ06643 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBQ06643 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBQ06643 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBQ06643 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBQ06643 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBQ06643 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBQ06643 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBQ06643 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBQ06643 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBQ06643 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBQ06643 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBQ06643 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBQ06643 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBQ06643 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBQ06643 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBQ06643 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms