Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTDSPL2Q05D32 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms