Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
ATP7AQ04656 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms