Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARID5AQ03989 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms