Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
TOP2BQ02880 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TOP2BQ02880 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms