Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 AL390039.1-201ENST00000399148 611 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 AC022679.2-201ENST00000522186 813 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 SERPINA9-201ENST00000298845 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 LYRM7-203ENST00000510516 604 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 AL139021.1-201ENST00000556734 436 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 AC098483.1-202ENST00000436515 967 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB1Q02641 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms