Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN7AQ01118 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN7AQ01118 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms