Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BEX3Q00994 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms