Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms