Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKL1Q00532 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms