Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
HDLBPQ00341 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HDLBPQ00341 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms