Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms