Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX3P78415 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX3P78415 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX3P78415 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX3P78415 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX3P78415 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX3P78415 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX3P78415 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX3P78415 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX3P78415 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX3P78415 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX3P78415 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX3P78415 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX3P78415 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX3P78415 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX3P78415 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX3P78415 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX3P78415 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX3P78415 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX3P78415 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX3P78415 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX3P78415 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX3P78415 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX3P78415 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX3P78415 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX3P78415 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX3P78415 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX3P78415 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX3P78415 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX3P78415 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX3P78415 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX3P78415 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX3P78415 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX3P78415 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX3P78415 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX3P78415 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX3P78415 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX3P78415 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX3P78415 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX3P78415 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX3P78415 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX3P78415 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX3P78415 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX3P78415 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX3P78415 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX3P78415 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX3P78415 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX3P78415 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX3P78415 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX3P78415 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX3P78415 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX3P78415 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX3P78415 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX3P78415 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX3P78415 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX3P78415 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX3P78415 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX3P78415 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX3P78415 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX3P78415 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX3P78415 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX3P78415 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX3P78415 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX3P78415 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX3P78415 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX3P78415 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX3P78415 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX3P78415 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX3P78415 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX3P78415 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX3P78415 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX3P78415 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX3P78415 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX3P78415 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX3P78415 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX3P78415 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX3P78415 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX3P78415 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX3P78415 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX3P78415 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX3P78415 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX3P78415 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX3P78415 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX3P78415 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX3P78415 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX3P78415 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX3P78415 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX3P78415 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX3P78415 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX3P78415 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX3P78415 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX3P78415 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX3P78415 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX3P78415 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX3P78415 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX3P78415 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX3P78415 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX3P78415 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX3P78415 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX3P78415 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms