Protein–RNA interactions for Protein: P78371

CCT2, T-complex protein 1 subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT2P78371 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT2P78371 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT2P78371 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT2P78371 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT2P78371 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT2P78371 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT2P78371 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT2P78371 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT2P78371 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT2P78371 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT2P78371 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT2P78371 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT2P78371 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT2P78371 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT2P78371 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT2P78371 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT2P78371 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT2P78371 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT2P78371 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT2P78371 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT2P78371 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT2P78371 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT2P78371 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT2P78371 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT2P78371 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT2P78371 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT2P78371 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT2P78371 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT2P78371 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT2P78371 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT2P78371 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT2P78371 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT2P78371 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT2P78371 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT2P78371 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT2P78371 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT2P78371 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT2P78371 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT2P78371 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT2P78371 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT2P78371 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT2P78371 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT2P78371 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT2P78371 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT2P78371 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT2P78371 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT2P78371 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT2P78371 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT2P78371 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT2P78371 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT2P78371 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT2P78371 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT2P78371 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT2P78371 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT2P78371 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT2P78371 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT2P78371 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT2P78371 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT2P78371 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT2P78371 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT2P78371 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT2P78371 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT2P78371 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT2P78371 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT2P78371 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT2P78371 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT2P78371 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT2P78371 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT2P78371 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT2P78371 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT2P78371 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT2P78371 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT2P78371 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT2P78371 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT2P78371 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT2P78371 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT2P78371 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT2P78371 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT2P78371 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT2P78371 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT2P78371 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT2P78371 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT2P78371 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT2P78371 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT2P78371 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT2P78371 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT2P78371 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCT2P78371 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCT2P78371 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT2P78371 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT2P78371 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT2P78371 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT2P78371 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT2P78371 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT2P78371 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT2P78371 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT2P78371 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT2P78371 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT2P78371 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT2P78371 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms