Protein–RNA interactions for Protein: P61587

RND3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND3P61587 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RND3P61587 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RND3P61587 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RND3P61587 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RND3P61587 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RND3P61587 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RND3P61587 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RND3P61587 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RND3P61587 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RND3P61587 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RND3P61587 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RND3P61587 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RND3P61587 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RND3P61587 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RND3P61587 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RND3P61587 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RND3P61587 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RND3P61587 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RND3P61587 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RND3P61587 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RND3P61587 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RND3P61587 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RND3P61587 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RND3P61587 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RND3P61587 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RND3P61587 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RND3P61587 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RND3P61587 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RND3P61587 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RND3P61587 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RND3P61587 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RND3P61587 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RND3P61587 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RND3P61587 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RND3P61587 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RND3P61587 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RND3P61587 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RND3P61587 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RND3P61587 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RND3P61587 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RND3P61587 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RND3P61587 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RND3P61587 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND3P61587 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND3P61587 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND3P61587 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND3P61587 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND3P61587 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND3P61587 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND3P61587 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND3P61587 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND3P61587 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND3P61587 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND3P61587 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND3P61587 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND3P61587 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND3P61587 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND3P61587 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND3P61587 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND3P61587 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND3P61587 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND3P61587 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND3P61587 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND3P61587 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND3P61587 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RND3P61587 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND3P61587 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND3P61587 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND3P61587 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND3P61587 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND3P61587 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND3P61587 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND3P61587 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND3P61587 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RND3P61587 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND3P61587 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND3P61587 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND3P61587 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RND3P61587 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RND3P61587 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RND3P61587 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RND3P61587 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RND3P61587 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RND3P61587 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RND3P61587 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RND3P61587 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RND3P61587 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RND3P61587 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RND3P61587 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RND3P61587 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RND3P61587 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RND3P61587 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RND3P61587 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RND3P61587 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RND3P61587 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RND3P61587 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RND3P61587 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RND3P61587 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RND3P61587 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RND3P61587 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms