Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms