Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTBP60709 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTBP60709 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTBP60709 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTBP60709 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTBP60709 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTBP60709 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTBP60709 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTBP60709 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTBP60709 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTBP60709 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTBP60709 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTBP60709 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTBP60709 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTBP60709 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTBP60709 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTBP60709 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTBP60709 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTBP60709 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTBP60709 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTBP60709 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTBP60709 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTBP60709 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTBP60709 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTBP60709 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTBP60709 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTBP60709 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTBP60709 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTBP60709 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTBP60709 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTBP60709 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTBP60709 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTBP60709 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTBP60709 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTBP60709 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTBP60709 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTBP60709 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTBP60709 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ACTBP60709 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ACTBP60709 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ACTBP60709 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ACTBP60709 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTBP60709 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTBP60709 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTBP60709 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTBP60709 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTBP60709 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTBP60709 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTBP60709 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTBP60709 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTBP60709 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTBP60709 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTBP60709 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTBP60709 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTBP60709 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTBP60709 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTBP60709 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTBP60709 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTBP60709 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTBP60709 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTBP60709 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTBP60709 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTBP60709 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTBP60709 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTBP60709 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTBP60709 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTBP60709 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTBP60709 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms