Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF3P57682 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF3P57682 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF3P57682 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF3P57682 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF3P57682 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF3P57682 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF3P57682 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF3P57682 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF3P57682 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF3P57682 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF3P57682 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF3P57682 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF3P57682 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF3P57682 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF3P57682 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF3P57682 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF3P57682 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF3P57682 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF3P57682 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF3P57682 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF3P57682 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF3P57682 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF3P57682 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF3P57682 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF3P57682 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF3P57682 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF3P57682 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF3P57682 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF3P57682 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF3P57682 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF3P57682 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF3P57682 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF3P57682 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF3P57682 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF3P57682 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF3P57682 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF3P57682 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF3P57682 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF3P57682 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF3P57682 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF3P57682 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF3P57682 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF3P57682 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF3P57682 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF3P57682 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF3P57682 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF3P57682 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF3P57682 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF3P57682 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF3P57682 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF3P57682 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLF3P57682 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLF3P57682 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF3P57682 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF3P57682 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF3P57682 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF3P57682 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF3P57682 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF3P57682 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF3P57682 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF3P57682 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF3P57682 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF3P57682 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF3P57682 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF3P57682 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF3P57682 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF3P57682 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF3P57682 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF3P57682 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF3P57682 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF3P57682 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF3P57682 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF3P57682 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF3P57682 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF3P57682 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF3P57682 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF3P57682 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF3P57682 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF3P57682 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF3P57682 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF3P57682 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF3P57682 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF3P57682 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF3P57682 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF3P57682 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms