Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY3P57055 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms