Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2BFSP57053 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms