Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EPHB4P54760 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EPHB4P54760 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EPHB4P54760 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EPHB4P54760 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EPHB4P54760 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EPHB4P54760 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EPHB4P54760 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EPHB4P54760 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EPHB4P54760 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EPHB4P54760 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EPHB4P54760 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EPHB4P54760 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms