Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATN1P54259 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATN1P54259 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATN1P54259 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATN1P54259 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATN1P54259 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATN1P54259 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATN1P54259 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATN1P54259 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATN1P54259 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATN1P54259 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATN1P54259 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATN1P54259 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATN1P54259 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATN1P54259 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATN1P54259 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATN1P54259 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATN1P54259 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATN1P54259 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATN1P54259 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATN1P54259 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATN1P54259 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATN1P54259 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATN1P54259 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATN1P54259 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATN1P54259 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATN1P54259 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATN1P54259 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATN1P54259 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATN1P54259 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATN1P54259 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATN1P54259 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATN1P54259 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATN1P54259 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATN1P54259 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATN1P54259 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATN1P54259 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATN1P54259 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATN1P54259 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATN1P54259 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATN1P54259 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATN1P54259 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATN1P54259 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATN1P54259 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATN1P54259 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATN1P54259 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATN1P54259 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATN1P54259 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATN1P54259 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATN1P54259 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATN1P54259 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATN1P54259 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATN1P54259 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATN1P54259 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATN1P54259 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATN1P54259 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATN1P54259 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATN1P54259 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATN1P54259 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATN1P54259 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATN1P54259 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATN1P54259 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATN1P54259 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATN1P54259 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATN1P54259 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATN1P54259 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATN1P54259 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATN1P54259 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATN1P54259 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATN1P54259 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATN1P54259 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATN1P54259 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATN1P54259 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATN1P54259 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATN1P54259 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATN1P54259 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATN1P54259 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATN1P54259 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATN1P54259 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATN1P54259 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATN1P54259 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATN1P54259 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATN1P54259 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATN1P54259 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATN1P54259 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATN1P54259 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATN1P54259 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATN1P54259 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATN1P54259 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATN1P54259 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATN1P54259 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATN1P54259 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATN1P54259 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATN1P54259 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATN1P54259 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATN1P54259 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATN1P54259 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATN1P54259 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATN1P54259 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATN1P54259 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms