Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms