Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPAP49450 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPAP49450 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPAP49450 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPAP49450 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPAP49450 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPAP49450 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPAP49450 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPAP49450 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPAP49450 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPAP49450 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPAP49450 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPAP49450 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPAP49450 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPAP49450 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPAP49450 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPAP49450 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPAP49450 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPAP49450 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPAP49450 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPAP49450 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPAP49450 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPAP49450 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPAP49450 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPAP49450 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPAP49450 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPAP49450 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPAP49450 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPAP49450 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPAP49450 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPAP49450 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPAP49450 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPAP49450 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPAP49450 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPAP49450 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPAP49450 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPAP49450 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPAP49450 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPAP49450 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPAP49450 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPAP49450 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPAP49450 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPAP49450 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPAP49450 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPAP49450 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPAP49450 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPAP49450 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPAP49450 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPAP49450 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPAP49450 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPAP49450 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPAP49450 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPAP49450 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPAP49450 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPAP49450 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPAP49450 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPAP49450 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPAP49450 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPAP49450 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPAP49450 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPAP49450 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPAP49450 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPAP49450 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPAP49450 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPAP49450 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPAP49450 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPAP49450 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPAP49450 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPAP49450 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPAP49450 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPAP49450 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPAP49450 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPAP49450 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPAP49450 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPAP49450 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPAP49450 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPAP49450 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPAP49450 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPAP49450 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPAP49450 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPAP49450 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPAP49450 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPAP49450 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPAP49450 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPAP49450 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPAP49450 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPAP49450 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPAP49450 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPAP49450 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPAP49450 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPAP49450 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPAP49450 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPAP49450 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPAP49450 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPAP49450 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPAP49450 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPAP49450 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPAP49450 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPAP49450 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPAP49450 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms